Važenje i primjena krivičnog zakona može se označiti kao prvorazredno krivičnopravno pitanje u BiH. To se, iznad svega, odnosi na ratne zločine i druga najteža krivična djela protiv međunarodnog humanitarnog prava, za koja se trenutno sudi. Trenutno su u primjeni dva režima ili dva pristupa u primjeni krivičnih zakona, u zavisinosti od toga da li ova krivična djela procesuira entitetsko pravosuđe ili Sud BiH.
Centar za javno pravo donosi analizu sudinice Apelacionog odjeljenja Suda BiH i saradnice FCJP, Azre Miletić, o krivičnopravnom okviru koji je nastao nakon potpisivanja Dejtonskog mirovnog sporazuma. U fokusu analize je različita primjena vladajućih krivičnopravnih principa pred sudovima u BiH. Kompletnu analizu možete preuzeti ovdje.